日本放射線醫學綜合研究所（National Institute of Radiological Science，NIRS）是一家日本輻射研究所。它于1957年作為日本僅有一所放射科學校而成立。它擁有各種離子加速器，以研究對人體輻射和輻射醫療用途。

日本放射線醫學綜合研究所組織結構：

審計與合規辦公室（總部）

規劃與管理系

總務科

研究、開發和支持中心

帶電粒子治療研究中心

醫院

分子影像中心

研究中心輻射防護

輻射應急醫學研究中心

輻射緊急醫療援助隊

人力發展資源中心

國際開放實驗室

醫療照射研究項目

福島工程指揮部

日本放射線醫學綜合研究所地址位于千葉縣稻毛區市Anagawa4-9-1。截至2012年，共有800名員工。