科學博物館（National Museum of Nature and Science）是日本一家科學博物館，位于在東京上野公園東北角。

科學博物館在1871年開業，已經更改過好幾個名字，其中包括：教育部博物館，東京博物館，東京科學博物館，日本科學博物館，以及2007年的科學博物館。它在上世紀90年代和2000年代重新裝修過，并提供各種各樣的自然歷史展覽和互動科學體驗。